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LightSpeed DNA Assembly Mix Plus LM8001MEN

DNA Assembly Mix Plus

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LightSpeed DNA Assembly Mix Plus

产品简介:

  基于重组原理的无缝克隆技术,作为新一代的克隆方法,不依赖繁琐的酶切、连接步骤,也不需要末端补平等操作,依据 DNA 片段与线性化载体末端的 15~25 nt 同源序列的重组,可将插入片段克隆至任意线性载体的任意位点,载体自连背景极低,是一种简单、快速、高效的 DNA 定向克隆技术。

  LightSpeed DNA Assembly Mix Plus 无缝克隆试剂盒,一次反应可完成单至多个 DNA 片段的重组,最快仅需 5 分钟即可完成单片段重组,且阳性率高于 95%。Mix 中添加的辅助因子,有效提高克隆阳性率;经优化的反应体系,能够一定程度上耐受未纯化 PCR 产物中含有的杂质。升级版的无缝克隆试剂盒具有更高的阳性率、更好的兼容性。

产品组成:

2022122010441090580

使用方法:

1. 实验流程概要

2022122010444796993

2. 线性化克隆载体制备

选择合适的克隆位点,对载体进行线性化,载体的线性化可以通过酶切或反向 PCR 扩增完成。

1 酶切制备 

推荐使用 LightSpeed 快速内切酶进行双酶切,使载体线性化完全,以降低转化背景(假阳性克隆);若使用单酶切进行线性化,可以适当延长酶切时间以减少环状质粒残留。 

注 1:经双酶切进行线性化的载体无需去磷酸化,经单酶切则需要去磷酸化; 

注 2:酶切完成后,应将快速内切酶失活或对目的产物纯化后再用于重组反应。 

2 反向 PCR 扩增制备 

为减少扩增突变的引入,推荐使用高保真 PCR Mix 进行扩增。推荐使用预线性化质粒作为模板,以减少环状质粒模板残留对克隆阳性率的影响。

3. 插入片段 PCR 引物设计

PCR 引物的 5'端必须包含与其相邻片段(插入片段或载体)末端同源的 15~25 nt(推荐 18 nt)序列。假如载体为粘性末端,且 3'端突出,则引物设计必须包含突出部分;若 5'端突出,则引物设计可以包含突出部分,也可以不包含。

插入片段正向扩增引物:

5'—上游载体末端同源序列+酶切位点(可选)+基因特异性正向扩增序列—3'

插入片段反向扩增引物:

3'—基因特异性反向扩增序列+酶切位点(可选)+下游载体末端同源序列—5'

注 1:尽量选择无重复序列且 GC 含量均匀的区域进行克隆,当载体克隆位点上下游 25 nt 区域内 GC 含量为 40%~60%时,重组效率最高;

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注 2:本试剂盒所提供的 pUC19 载体(Ampr)连接端序列如下:

2022122010491374186

4. 插入片段的 PCR 扩增

推荐使用高保真 PCR Mix 进行扩增,以减少扩增突变的引入。建议使用纯化后的 PCR 产物进行无缝克隆反应,若 PCR 产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定为特异性扩增产物,可直接使用,但加样体积不应超过总反应体积的 20%。

5. 重组反应

①于冰水浴中配置以下反应体系:

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注 1:若插入单片段的长度大于载体,则应互换载体与插入片段用量;

注 2:若插入片段的长度小于 200 bp,则插入片段应使用 5 倍载体用量;

注 3:若按上述公式计算得到的用量超过最低/最高值,则建议直接按最低/最高用量使用;

注 4:载体片段过长、插入片段过长或片段数过多,克隆阳性率均会降低。

a. 最适载体用量(ng)=0.02×载体碱基对数,即 0.03 pmol。

b. 插入单片段,最适片段用量(ng)=0.04×片段碱基对数;插入多片段,每片段最适用量(ng)=0.02×片段碱基对数。

重组反应体系配制完成后,用移液枪轻轻吸打混匀各组分,避免产生气泡,切勿涡旋。

②将反应体系置于 50℃,反应 5~60 分钟。

注 1:推荐使用 PCR 仪等温控比较精准的仪器进行反应,反应时间不足或太长克隆效率均会降低;

注 2:插入 1~2 个片段时,推荐反应时间为 5~15 分钟;插入 3~5 个片段时,推荐反应时间为 15~30 分钟;

注 3:当载体骨架在 10 kb 以上或插入片段在 4 kb 以上时,建议延长反应时间到 30~60 分钟;

注 4:50℃反应完成后,建议进行瞬时离心,将反应液收集至管底。 

③将反应液离心管置于冰上冷却,之后进行转化或者储存于-20℃。

注 1:-20℃储存的重组产物,建议在 1 周内使用;

6. 重组产物转化

取 5~10μl 反应液,加入到 100 μL 感受态细胞中,缓慢吸打混匀,冰上放置 30 分钟。42℃热激 45~60 秒,冰浴 5 分钟。加 500 μL SOC 或 LB 培养基,37℃振荡培养 40~60 分钟(200 rpm)。将菌液均匀涂布在含有对应抗生素的平板上,倒置于 37℃过夜培养。

注 1:不同感受态细胞最后的克隆阳性率会有所差别,推荐使用转化效率>108 CFU/μg 的感受态细胞;

注 2:菌落数取决于 PCR 产物与线性化载体的数量和纯度;

注 3:阳性对照平板通常生长大量白色单菌落,阴性对照平板只生长很少的菌落

7. 阳性克隆检测

挑取单菌落至 10 μL ddH2O 中混匀,95℃裂解 10 分钟后,取 1 μL 裂解液作为模板,进行菌落 PCR 鉴定,或将单菌落接种至抗性培养基中培养过夜后,提取质粒进行酶切鉴定。

阳性对照的阳性克隆检测,菌落 PCR 引物使用通用引物 M13F 与 M13R,酶切鉴定用 HindIII 与 EcoRI。

注 1:菌落 PCR 时建议至少使用一条通用引物,避免假阳性结果;

注 2:必要时可进一步对阳性结果进行测序鉴定。

注 3:M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT

M13R:CAGGAAACAGCTATGAC

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